Iako ga prati glas izrazito vještog operativca, ako Brkić postane ministar, pratit će ga jedna velika afera, a to je prepisani diplomski rad. Rad pod nazivom 'Organizacijske razine MUP-a RH' iz 2011. prepisan je iz rada policijskog načelnika Stanka Tomića iz 2009. Zbog proceduralne greške Visoke policijske škole, Upravni sud u Zagrebu odlučio je da Brkiću diplomski rad ostaje, iako je i dalje nepobitno da je riječ o plagijatu.

'Ne bi ni došlo do ove kandidature bez suradnje', rekao je Brkić na upit podržava li Most njegovu kandidaturu i dodao 'da se nisu ranije protivili tome i da su to sve nagađanja'. Kazao je i da je počašćen kandidaturom Domoljubne koalicije i Mosta nezavisnih lista, a ako i kad bude izabran, moći će komentirati prve poteze, javlja n1.info