NOVI ZADATAK ZA WATSONA

IBM-ovo superračunalo pomoći će u liječenju raka

25.03.2014 u 06:11

Bionic
Reading

Watson će moći stalno 'učiti', scenarij po scenarij, suočavajući se sa svakim novim pacijentom i obrađujući informacije koje će mu biti dostupne iz novih medicinskih istraživanja, časopisa i kliničkih studija

Centar za istraživanje genoma u New Yorku (The New York Genome Center - NYGC) i tvrtka IBM pokrenuli su inicijativu koja za cilj ima ubrzati ostvarenje genomske medicine uporabom kognitivnog računalnog sustava IBM Watson.


IBM i NYGC zajedno će testirati prototip Watson računalnog sustava, oblikovanog i konfiguriranog za istraživanje genoma. Watson treba postati alat koji će onkolozima pomoći u osmišljavanju personaliziranih načina liječenja ljudi oboljelih od raka.

NYGC i partnerske medicinske ustanove planiraju ustanoviti može li im Watson pomoći u osmišljavanju potpuno individualiziranih načina liječenja pacijenata koji boluju od glioblastoma, agresivnog malignog tumora koji svake godine ubije više od 13 tisuća ljudi samo u SAD-u.

Unatoč izvanrednim otkrićima o genetskim pokretačima raka, kao što je glioblastom, tek je nekoliko pacijenata do sada imalo koristi od personaliziranih tretmana posebno prilagođenih njihovim individualnim mutacijama raka.

Liječnici do sada nisu imali ni vremena ni alate kojima bi terapije utemeljene na specifičnostima DNK primijenili na pacijentima. Da bi to mogli, moraju povezati podatke koje prikupljaju sekvencioniranjem (čitanjem) gena s podacima iz istraživanja objavljenima u medicinskim časopisima, novim studijama i s podacima koji su pohranjeni u bolničkim evidencijama.

Problem s time je što to moraju učiniti u doba u kojem se količina medicinskih podataka udvostručava svakih pet godina.

NYGC i IBM žele ubrzati te složene procese - prepoznati obrasce koji se pojavljuju tijekom sekvencioniranja genoma i analize medicinskih podataka kako bi došli do uvida koji će liječnicima pomoći u ostvarenju svih obećanja genomske medicine.


Sustav Watson, dostupan kao usluga u računalnom oblaku, bit će konfiguriran za analizu genetskih podataka, opsežne bio-medicinske literature i baze podataka s informacijama o lijekovima.

Watson će moći stalno 'učiti', scenarij po scenarij, suočavajući se sa svakim novim pacijentom i obrađujući informacije koje će mu biti dostupne iz novih medicinskih istraživanja, časopisa i kliničkih studija.

Ovisno o Watsonovoj sposobnosti temeljite i brze obrade golemih baza podataka u projekt suradnje NYGC-a i IBM-a uključivat će se sve veći broj pacijenata kojima će biti propisivane terapije na temelju specifičnosti DNK molekule njihove bolesti.

Watson će upotpuniti metode brzog sekvencioniranja genoma. Očekuje se da će dramatično smanjiti vrijeme koje je potrebno za usporedbu podataka koji se prikupljaju promatranjem genetskih mutacija kod pojedinog pacijenta s podacima koji se nalaze u medicinskoj literaturi, liječničkim nalazima, istraživanjima i u relevantnim terapeutskim indikacijama.

Namjera je doći do što više informacija koje će liječnicima omogućiti razmatranje većeg broja terapija nego što bi to mogli samo na temelju promatranja genetskih mutacija koje uočavaju kod svojih pacijenata.

Watson će također pomoći znanstvenicima u centru NYGC u shvaćanju podataka do kojih dolaze putem biopsija tkiva, detaljnim sekvencioniranjem genetskih varijacija normalnih i kancerogenih tumora mozga.