Uzrok smrti još nije preciziran, ali čelnik najveće istočne kršćanske crkve je godinama bolovao.

Prema pisanju službene egipatske agencije Mena, Šenuda III. je imao problema s jetrom i plućima.

Šenuda III. je postao poglavar pravoslavske koptske crkve 1971. i bio je 117. nasljednik utemeljitelja apostola Marka. Odlučno je vodio svoju zajednicu suočenu s islamizacijom egipatskog društva.

Kopti su ga smatrali zaštitnikom njihove manjinske zajednice u zemlji čije većinsko stanovništvo čine muslimani.

Šenuda III. nikada nije prestao podržavati vladu Hosnija Mubaraka i nije se previše energično zalagao za koptske zahtjeve kako ne bi izazvao muslimanske konzervativce, što mu je zamjerao dio kršćana koji su smatrali da ne poduzima dovoljno protiv nasilja i diskriminacije njihove zajednice u razdoblju nakon Mubaraka.

Prema procjenama Kopti predstavljaju između 6 i 10 posto od 82 milijuna Egipćana. Koptska crkva navodi kako ima 10 milijuna vjernika.